Varga Orsolya - Fenntartható biotechnológiák mesteri szak, II. év

Magyar Tudományos Akadémia Szegedi Biológiai Kutató Központ

Magyarország

Az Erasmus+ szakmai gyakorlatomat a Magyar Tudományos Akadémia Szegedi Biológiai Kutató Központban töltöttem, az Arabidopsis Molekuláris Genetikai csoportban, melynek vezetője dr. Szabados László. A mentorom dr. Rigó Gábor a kutató csoport munkatársa volt.

A szakmai gyakorlat során a CRK5 kináz biokémiai és molekuláris biológia vizsgálatában vettem részt. Arabidopsis CRK5 protein kináz részt vesz a gyökér és szár gravitropikus válaszának szabályozásában. Az Arabidopsis CRK protein kináz család nyolc, erősen homológ tagból áll. A CRK család eddigi funkcionális jellemzése nagyon hiányos, annak ellenére, hogy a család tagjai, mint Ca²⁺/ CaM- kötő fehérjék, valószínűleg jelentős szerepet játszanak a növények fejlődésbeli és stressz válaszainak szabályozásában. A kutatócsoport egyik célja a CRK család nyolc tagjának funkcionális jellemzése a gyökérfejlődés, az abiotikus és a gravitropikus stresszválasz szabályozása szempontjából.

A szakmai gyakorlatom során számos molekuláris és biokémiai technológiát tanulhattam. Az alábbi módszerekben szereztem tapasztalatot: CRK5 analóg szenzitív változat klónozása bakteriális expressziós vektorba (pET28c): restrikciós emésztési és ligálási reakciók, agaróz és SDS poliakrilamid gélelektroforézis, transzformálás bakteriális kompetens sejtbe (E. coli DH5 α illetve BL21DE3 Rosetta), a transzformáció ellenőrzése colony PCR-el, pozitív klónok kiválasztása és plazmid DNS tisztítása alkalikus lízis miniprep módszerrel. A plazmid konstrukciók helyességét restrikciós enzim segítségével határoztuk meg. A megfelelő klónokat ezután BL21DE3 Rosetta fehérjetermelő sejtekbe juttattuk.  Rekombináns CRK5 fehérje tisztítása baktériumsejtből Ni-NTA agaróz alapú affinitáskromatográfiával. A tisztított fehérjéket SDS poliakrilamid gélelektroforézissel valamint Western hibridizációval ellenőriztük le. Kináz aktivitás vizsgálata a tisztított fehérjék segítségével nem radioaktív ATPγS jelenlétében (thiofoszforiláció), kináz-assay módszer segítségével.A tio-foszforilációs reakció kimutatása Western-blottal történt, speciális ellenanyag felhasználásával. Specifikus gén konstrukcióval rendelkező Agrobacteriumok nevelése és infiltrációs transzformálása Arabidopsis thaliana virágzatba.

A munka mellett sort kerítettünk a szórakozásra is, és ha már Szegeden voltunk Magyarország harmadik legnagyobb városában volt is lehetőség mindenféle szórakozásra: nagyon sok fesztiválnak ad helyszínt Szeged, amelyből néhányra mi is eljuthattunk (Hungaricum fesztivál, Rakpart feszt). Eljártunk a Móra Ferenc múzeumba, a Kass galériába, és a Fekete házba, ahol megnézhettük Pompeji katasztrófáját, az ott élt emberek életét, mindennapjait, hitvilágát, kikapcsolódási szokásait, harcászatát, valamint állandó kiállításukat.

És ha nyár kihagyhatatlan élményeket kínál a szegedi Napfényfürdő Aquapolis Wellness-, Gyógy- és Élményfürdő, ahol Európa leghosszabb vízi csúszdája található, valamint az Anna fürdő ahol akár éjszakai fürdőzésben is részt vehettünk.

Meglátogattuk a szegedi Vadaspark lakóit, ami nem csak gyerekeknek, hanem felnőtteknek is felejthetetlen élményt nyújt.

Egy vasárnap vonatra ültünk és felutaztunk Budapestre, hogy megnézhessük a Forma 1 Magyarországi futamát a Hungaroringen, és élőben szurkolhassunk Fonzival kedvenceinknek.

Köszönettel tartozom az Erasmus+ programnak, hogy biztosították a lehetőséget számomra, hogy részt vegyek a szakmai gyakorlaton, valamint a Sapientia EMTE munkatársainak, és a Szegedi Biológiai Kutatóközpont Arabidopsis Molekuláris Genetikai csoport munkatársainak, hogy náluk dolgozhattam.

2016.09.21.