Bogye Dalma-Regina

A 2024/2025-ös tanévben az Erasmus+ programnak köszönhetően, már második alkalommal tölthettem Magyarországon a nyári szakmai gyakorlatomat szaktársammal, Kánya Szendével. A gyakorlat helyszíne ezen a nyáron is Budapest volt, ezen belül is a Semmelweis Egyetem Molekuláris Biológia Tanszéke. Lehetőségem volt bekapcsolódni Dr. Hajdú Gábor kutatásába.

A gyakorlat során Caenorhabditis elegans fonálféreggel dolgoztunk és gazda-kórokozó kölcsönhatásokat vizsgáltunk. A C. elegans az egyik legszélesebb körben használt modellszervezet a molekuláris és sejtbiológiai kutatásokban. Előnyei közé tartozik az egyszerű, de jól feltérképezett anatómiai felépítése, rövid életciklusa és átlátszó teste. E tulajdonságok lehetővé teszik, hogy a kutatók részletesen vizsgálják a fejlődés, az öregedés, az idegrendszeri folyamatok és a kóros állapotok molekuláris mechanizmusait. A C. elegans evolúciósan konzervált molekuláris válaszokkal reagál a különféle környezeti kihívásokra, beleértve a stresszhatásokat és a kórokozókkal való találkozást. Immunválaszait és stresszreakcióit számos, magasabb rendű szervezetekben is megőrzött jelátviteli útvonal szabályozza, ami lehetővé teszi, hogy eredményei széles körben értelmezhetők legyenek. Ezáltal a fonálféreg, mint modell, hozzájárul az emberi betegségek jobb megértéséhez is. A fonálférget sokféle emberi kórokozó képes megfertőzni, pusztán azáltal, hogy az E. coli OP50 törzset tartalmazó NGM táptalajról átviszik a kórokozót tartalmazó táptalajra. A legszélesebb körben tanulmányozott patogén a Pseudomonas aeruginosa. A különböző P. aeruginosa törzsek többféle mechanizmussal képesek elpusztítani a fonálférget. Mi a PA14 törzzsel dolgoztunk, mely alacsony ozmolaritású körülmények között a fonálféreg bélrendszerében telepedik meg és osztódik, míg magas ozmolaritásnál kis molekulatömegű toxinokat termel, általuk képes elpusztítani a fonálférgeket.

Elsősorban egy kandidáns immun effektor gén expressziójának változását, valamint ezen effektor és egy immunválaszban esszenciális szerepet játszó C. elegans nukleáris hormon receptor kapcsolatát vizsgáltuk C. elegans törzsekben, különböző előkezelések esetén. Összesen három előkezelést alkalmaztunk, az elsőnél a fonálférgeket P. aeruginosa PA14 törzzsel beoltott lemezre helyeztük, a másodiknál P. aeruginosa PA14 illatát használtuk fel, a harmadiknál pedig 1-undecén illatot. Az 1-undecén egy illékony szerves vegyület, melyet a P. aeruginosa is termel és olfaktorosan hat a fonálférgek idegrendszerére, ezáltal riasztó jelként működik. Az előkezelések időtartama pedig 24, illetve 4 óra volt. Az idő lejárta után fluoreszcens mikroszkóppal fotókat készítettünk a fonálférgekről, az elkészült fotókat ImageJ szoftverrel dolgoztuk fel, az adatokat Excel-be vezettük be és dolgoztuk fel megadott templát alapján. 

Elvégeztünk tolerancia-teszteket is (fonálférgek kezelése antimycin-es oldattal, valamint PGS táptalajon való kezelés) bizonyos C. elegans törzseknél annak érdekében, hogy bebizonyítsuk, a kórokozó-eredetű molekulákkal való előzetes találkozás nagyobb toleranciát alakít ki. Patogénnel szembeni tolerancia-teszt esetén is előkezeléseket alkalmaztunk. Az idő lejárta után PGS tartalmú táptalajokra helyeztük őket, több párhuzammal dolgoztunk. A tolerancia teszt 24 órán át tartott, ezt követően pedig minden Petri lemez esetén megszámoltuk az élő és össz-egyedeket, az így nyert adatokat Excel-be vezettük be és értékeltük ki.

Más kandidáns gén, immun effektor expresszióját is megvizsgáltuk különböző C. elegans törzsek esetén. Ehhez a fonálférgeket szintén előkezeltük, majd összegyűjtöttük és átmostuk őket. Folyékony nitrogénnel fagyasztottuk őket, ezt követően pedig RNS-t izoláltunk belőlük. Az izolált RNS-ek mennyiségét és minőségét Nanodrop One-al, majd gélelektroforézissel határoztuk meg. A mintákat tisztítottuk, cDNS-t készítettünk belőlük, végül RT-qPCR-t alkalmazva megállapítottuk a kiválasztott gén expresszió-szintjét.

A munka mellett természetesen jutott egy kis idő a kikapcsolódásra és szórakozásra is. Persze mindenki mást ért pihenés alatt: van, aki a nyugodt sétákat kedveli, más inkább a pezsgő városi programokat keresi, mi inkább az előbbiek táborát erősítjük. A főváros nevezetességei közül nem maradhatott ki az Országház, amelyet egy hangulatos sétahajókázás keretében csodáltunk meg, egészen más élményt nyújt ebben a formában a város, különösen esti fényekben. Az augusztus 20-ai tűzijátékot idén is kipipáltuk, másként, mint tavaly, de így is nagyszerű volt. A programok között akadt könnyedebb élmény is, hiszen sikerült eljutnom a Dumaszínházba, ahol Hadházi László és Mogács Dániel önálló estjeit láthattam. Őszintén ajánlom mindenkinek, aki szereti a humort, mert ezek az estek valóban felejthetetlenek.

Összegezve elmondhatom, hogy munkám során kipróbálhattam számos laboratóriumi technikát. Dolgozhattam fluoreszcens mikroszkóppal, értékelhettem kísérleti eredményeket, valamint adatfeldolgozási módszereket is tanulhattam. Érdekes volt látni azt is, hogy a laborban végzett munka nem csupán technikai feladatok sorozata, hanem kreatív gondolkodást és problémamegoldást is megkövetel.

Elsősorban köszönettel tartozom Dr. Hajdú Gábornak, valamint a Semmelweis Egyetem Molekuláris Biológiai Tanszék munkacsoportjainak. Nagyra értékelem azt a szakmai és emberi támogatást, amelyet a közös munka során kaptam. Külön öröm számomra, hogy egy olyan inspiráló közegben dolgozhattam, ahol a tudomány iránti elkötelezettség és a segítőkészség minden nap érezhető volt, még akkor is, amikor nem minden sikerült úgy, ahogy azt elterveztük. Hálás vagyok azért, hogy nem csak tudományos ismeretekkel gazdagodtam, hanem olyan kapcsolatokkal is, amelyek bátorítást és motivációt jelentettek és jelentenek a mai napig számomra.